Суд над Виталием Манишиным стартовал 3 июня 2024 года в Калманке. Открытым для прессы было лишь первое заседание, на котором решался вопрос продления меры пресечения подозреваемому. На это заседание Виталий Манишин вышел в капюшоне и скрывал лицо. Тогда же судья решила, что все заседания по делу будут закрытыми, так как жертвами преступника были несовершеннолетние. Поэтому детали произошедшего, которые звучали на заседаниях, пока остаются тайной.

Однако в Калманском районном суде amic.ru постоянно рассказывали, как движется сам процесс. Сначала суд изучал каждый эпизод по отдельности. Обстоятельства исчезновения и гибели всех 11 девушек и женщин он закончил разбирать только 23 октября 2024 года. Жертвы шли в хронологическом порядке, так что в последнюю очередь в суде рассматривали детали смерти Ксении Киргизовой. Затем на процессе допрашивали так называемых «общих» свидетелей, не связанных с конкретными эпизодами.

Так как Калманский районный суд закрылся на капитальный ремонт, с 21 апреля судебные заседания проходили в Железнодорожном суде Барнаула. Официально процесс туда не переносили, и судье Калманского районного суда пришлось ездить на них из Калманки в Барнаул.

В мае 2025 года суд завершил исследование доказательств по делу, а в июле 205 года вышел на стадию прений сторон. 13 августа гособвинение запросило для Манишина максимально возможный срок — 25 лет лишения свободы с отбыванием первых семи лет в тюрьме, а оставшегося срока — в исправительной колонии строго режима. Именно такой срок преступник и получил по приговору, который Калманский районный суд вынес Манишину 1 октября 2025 года. Пожизненный срок Манишину не дали в связи с истечением срока давности по преступлению.