Серия загадочных исчезновений потрясла весь город. Милиция работала с разными версиями — даже с самыми фантастическими. На тот момент начальник УВД Барнаула Николай Турбовец рассказывал, что милиция отрабатывала версию вывоза девушек
за пределы Алтайского края и за границу, похищение с целью выкупа или для пересадки органов. Также были слух, что девочки найдены в подвале, что абитуриенток видели в Казахстане или их увезли в Чечню, писал «СК». Однако все это органы следствия
не подтвердили.
После исчезновения Киргизовой все розыскные дела переквалифицировали в уголовные и объединили.
Расследование поручили специально созданной следственно-оперативной группе, в которую вошли
сотрудники уголовного розыска и прокуратуры Барнаула.

Милиция провела обыски во всех семи корпусах вуза, там обследовали все подземные коммуникации и колодца,
- подвалы, чердаки, колодцы и теплотрассы. Вскрывались все помещении - даже те, в которые никто давно
не заглядывал, пишет «СК». В работе участвовали все силовые структуры. Расследованием занимался
Октябрьский РОВД Барнаула. Оперативная группа при ГУВД изучала каждый факт исчезновения девочек,
допрашивала сотни людей. Работа шла в круглосуточном режиме.
Однако всё это результатов не дало. И Ксения Киргизова пропала, когда в вузе уже работала милиция.
Правоохранители прочесывали пригородный ленточный бор.
4 сентября правоохранители нашли в лесу вещи Ксении Кирзизовой,
а именно её записную книжку, одежду (кроме белья) и кроссовки.
В октябре милиция начала находить трупы пропавших девушек
в лесу Калманского района одного за другим.